Иновативен метод за борба с болестите по културите с помощта на местни полезни почвени бактерии се появи от сътрудничеството между науката и индустрията.
Екип от учени от Центъра Джон Инес (Обединеното кралство) изолира и тества стотици щамове на бактерии Pseudomonas от почва, събрана от ферми, и след това секвенира геномите на 69 от тях.
Чрез сравняване на геномите на тези щамове, които инхибират патогенната активност с тези, които не го правят, екипът успя да идентифицира ключов механизъм за защита на картофената реколта от вредни бактерии.
След това, използвайки комбинация от химия и генетика и серия от експерименти, учените показаха, че производството на малки молекули, наречени циклични липопептиди, е важно за контролиране на струпясването (бактериално заболяване, което причинява значителни щети на картофената култура). Тези малки молекули имат антибактериален ефект върху патогенните бактерии, причиняващи струпясване, и помагат на полезните бактерии Pseudomonas да мигрират и колонизират корените на растенията.
Експериментите показват също, че напояването причинява значителни промени в генетично разнообразната популация на Pseudomonas в почвата.
Изследването, публикувано в eLife, предлага метод, чрез който учените могат да изследват микробиома на почти всяка област от полето и да вземат предвид различни почвени, агрохимични и екологични условия.
Използвайки напредъка във високоскоростното генетично секвениране, учените могат да тестват почвения микробиом за полезни бактерии и да определят кои молекули се произвеждат за потискане на патогените. Следващата стъпка е размножаването и връщането на полезните микроорганизми в същото поле.
Потенциалните приложения за подобрители на микробиома включват прилагане на бактериални коктейли върху повърхността на грудките като спрей или директно в почвата с помощта на капково напояване.